8月26日，学校利用一整天的时间召开全面深化改革领导小组第二次会议，听取各专项小组关于调研情况和改革初步方案的汇报，对下一步工作做出进一步安排部署。学校全面深化改革领导小组组长申林同志主持会议并做重要讲话。学校全面深化改革领导小组及办公室成员参加会议。
　　会上，教育教学工作改革专项小组、科研工作改革专项小组、外事工作改革专项小组、学生工作改革专项小组、行政事务工作改革专项小组、总务后勤工作改革专项小组、产业工作改革专项小组、党建工作改革专项小组、群团工作改革专项小组、现代大学制度专项小组等10个专项小组的18位同志先后发言，对前一阶段开展调研时的收获与启示以及全面深化改革初步方案做了详细深入的汇报。
　　在认真听取汇报后，申林同志做重要讲话。他首先对各专项小组前一阶段的工作给予了充分肯定。申林同志指出，各专项小组在充分开展调研的基础上，提出的改革的基本思路和初步设想，符合党和国家以及教育部对高等教育全面深化改革的要求部署，符合学校党委提出的“四个围绕”，符合学校实际，对学校全面深化改革顶层设计奠定了良好的基础。下一阶段，要集中力量，尽快制定出改革的初步方案。同时，进一步调动全校上下参与改革的积极性、主动性和创造性，组织包括院系领导班子成员、教师、职工、学生、民主党派等各层面代表参加的座谈会，征求更加广泛的意见，凝聚全校师生员工的改革共识。
　　申林同志就如何制定符合学校实际的深化改革综合方案提出三点重要指导意见。一是要高度重视学校的综合改革工作。习近平总书记在五四重要讲话中明确要求，全国高等院校要走在教育改革前列，紧紧围绕立德树人的根本任务，加快构建充满活力、富有效率、更加开放、有利于学校科学发展的体制机制，当好教育改革排头兵。党和国家高度重视高等教育综合改革，对高等学校深化改革工作提出了较高的要求。我们要深刻把握改革进入深水区的特征和特点，发扬不等、不靠的精神，尽快制定出符合学校实际的，具有系统性、配套性、协调性的综合改革方案。二是要在积极推动改革中体现担当精神。当前，中央反复强调强化改革责任担当精神对于全面推进改革的重要性。推进改革是一件及其复杂的工作，要打破利益固化的藩篱，我们学校的改革也是如此，许多改革将会涉及利益格局的变革。各部门、各单位主要负责同志是学校的骨干力量，大家能不能担当，敢不敢担当，能不能担当得起来，关系着学校的改革事业能不能推动，能不能达到预期效果，能不能实现最终目标。大家要树立起这样的担当精神，以只争朝夕，不达到目标不罢休的改革精神，全力推进综合改革工作。三是要精心做好当前顶层设计工作。近期要着力做好的工作，就是要以各专项小组分散起草，改革办最终汇总的方式，精心起草初步的综合改革实施方案。在改革方案的设计中要把握好三个原则性问题，即明确“五个目标”，体现“四个方面”，包含“六项内容”。改革方案起草中要明确的“五个目标”分别是：1.理清理念思路；2.理顺体制机制；3.厘清职能职责；4.健全规章制度；5.建立新常态工作模式。改革方案起草中要体现的“四个方面”分别是：1.要承继自己的办学经验，即传承学校办学中好的经验和做法；2.要吸收别人的长处，即要体现出调研中的收获和启示；3.要贯彻上级的要求，即要吃透理解党和国家以及教育主管部门的要求部署；4.要体现发展的方向。即要体现建设应用技术大学的学校总体发展目标。改革方案起草中要包含的“六项内容”分别是：1.改理念；2.改思路；3.改章程；4.改机制；5.改模式；6.改作风。申林同志同时强调，要特别注重改革的整体性、配套性和协调性，在综合改革方案制定中不能各唱各的调，各吹各的号，更不能单打独斗。对于时间节点的把握，总体要求是要有改革的紧迫感，能改的不要拖，条件不成熟的也不要急于推进。要明确改革任务中哪些是条件成熟的，哪些是政策要求的，哪些是影响发展的，哪些是师生期盼的，科学设计好近期、中期和长期的改革任务。